Cồn Nổi Kim Sơn có diện tích gần 1000 ha, nằm cách bờ đê biển Bình Minh 4 (Ninh Bình) 4 km, cách phao số 0 cửa Đáy 5 km.[1] Cồn Nổi nằm ở tọa độ 19°53'50" độ Vĩ bắc và 106°00'35" độ Kinh đông. Từ thành phố Ninh Bình theo Quốc lộ 10 về hướng đông nam 27 km tới thị trấn Phát Diệm, tiếp tục theo quốc lộ 12B về phía Nam 15 km đến bờ biển Kim Sơn để ra Cồn Nổi.

• Khoảng cách đường chim bay từ Cồn Nổi tới các khu vực lân cận như sau:

Cồn Nổi được hình thành từ việc bồi đắp phù sa cửa sông Đáy và được khai thác từ năm 2003 bởi một thủy thủ tên Trần Văn Thông - người Ninh Bình. Khi tàu đánh cá của ông bị mắc cạn nơi đây, ông đã khám phá vùng đất này rồi sau đó đề xuất với địa phương xin được thực hiện dự án trồng phi lao chắn sóng và nuôi trồng thủy sản tại đây.[2]

Gần Cồn Nổi có đảo Cồn Mờ cũng nằm trong hải phận tỉnh Ninh Bình, cách bờ biển Kim Sơn khoảng 5 km, về phía đông đông nam, có diện tích xấp xỉ 3 km2 đã và đang được khai thác để trồng rừng ngập mặn trên đảo và rừng chắn sóng xung quanh.[3]